Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms