Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smg9Q9DB90 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg9Q9DB90 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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