Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fundc1Q9DB70 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms