Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp5oQ9DB20 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp5oQ9DB20 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp5oQ9DB20 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp5oQ9DB20 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp5oQ9DB20 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp5oQ9DB20 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp5oQ9DB20 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp5oQ9DB20 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms