Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scp2d1Q9DAH1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scp2d1Q9DAH1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms