Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm2bQ9DAC0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm2bQ9DAC0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm2bQ9DAC0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm2bQ9DAC0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm2bQ9DAC0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm2bQ9DAC0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm2bQ9DAC0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2bQ9DAC0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2bQ9DAC0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2bQ9DAC0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2bQ9DAC0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2bQ9DAC0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2bQ9DAC0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2bQ9DAC0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2bQ9DAC0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2bQ9DAC0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2bQ9DAC0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2bQ9DAC0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2bQ9DAC0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2bQ9DAC0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtm2bQ9DAC0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm2bQ9DAC0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm2bQ9DAC0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm2bQ9DAC0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm2bQ9DAC0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm2bQ9DAC0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm2bQ9DAC0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm2bQ9DAC0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm2bQ9DAC0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm2bQ9DAC0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms