Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snx5Q9D8U8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx5Q9D8U8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms