Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c6Q9D8P7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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