Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fip1l1Q9D824 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms