Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms