Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chmp5Q9D7S9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms