Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I9

Tgm5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm5Q9D7I9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tgm5Q9D7I9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tgm5Q9D7I9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tgm5Q9D7I9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tgm5Q9D7I9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tgm5Q9D7I9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tgm5Q9D7I9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tgm5Q9D7I9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tgm5Q9D7I9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tgm5Q9D7I9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgm5Q9D7I9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms