Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms