Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc94Q9D6J3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc94Q9D6J3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms