Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfn4Q9D6I3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfn4Q9D6I3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms