Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb4aQ9D6F9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms