Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sdr42e1Q9D665 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sdr42e1Q9D665 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdr42e1Q9D665 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.1 ms