Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc81Q9D5W4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms