Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap53Q9D439 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap53Q9D439 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms