Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpn3Q9D3W4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpn3Q9D3W4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpn3Q9D3W4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpn3Q9D3W4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpn3Q9D3W4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpn3Q9D3W4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpn3Q9D3W4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpn3Q9D3W4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpn3Q9D3W4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpn3Q9D3W4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpn3Q9D3W4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms