Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rsph14Q9D3W1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph14Q9D3W1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms