Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rasgef1cQ9D300 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rasgef1cQ9D300 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rasgef1cQ9D300 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rasgef1cQ9D300 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rasgef1cQ9D300 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rasgef1cQ9D300 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rasgef1cQ9D300 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rasgef1cQ9D300 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rasgef1cQ9D300 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rasgef1cQ9D300 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rasgef1cQ9D300 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rasgef1cQ9D300 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rasgef1cQ9D300 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rasgef1cQ9D300 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rasgef1cQ9D300 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rasgef1cQ9D300 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rasgef1cQ9D300 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rasgef1cQ9D300 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rasgef1cQ9D300 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rasgef1cQ9D300 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rasgef1cQ9D300 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rasgef1cQ9D300 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rasgef1cQ9D300 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rasgef1cQ9D300 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rasgef1cQ9D300 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasgef1cQ9D300 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms