Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D2Q3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D2Q3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D2Q3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D2Q3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D2Q3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D2Q3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D2Q3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D2Q3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Q9D2Q3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D2Q3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms