Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fndc8Q9D2H8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fndc8Q9D2H8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fndc8Q9D2H8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fndc8Q9D2H8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fndc8Q9D2H8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fndc8Q9D2H8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fndc8Q9D2H8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fndc8Q9D2H8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fndc8Q9D2H8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fndc8Q9D2H8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fndc8Q9D2H8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fndc8Q9D2H8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms