Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2bQ9D1Y9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms