Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q4

Dpm3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpm3Q9D1Q4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Dpm3Q9D1Q4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpm3Q9D1Q4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms