Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Necap2Q9D1J1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms