Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms