Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1G1

Rab1b, Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1bQ9D1G1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab1bQ9D1G1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab1bQ9D1G1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms