Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms