Protein–RNA interactions for Protein: Q9D180

Cfap57, Cilia- and flagella-associated protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap57Q9D180 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cfap57Q9D180 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cfap57Q9D180 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap57Q9D180 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap57Q9D180 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap57Q9D180 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap57Q9D180 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap57Q9D180 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap57Q9D180 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap57Q9D180 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap57Q9D180 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap57Q9D180 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap57Q9D180 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap57Q9D180 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap57Q9D180 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap57Q9D180 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms