Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hddc3Q9D114 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Hddc3Q9D114 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Hddc3Q9D114 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hddc3Q9D114 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms