Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmem53Q9D0Z3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem53Q9D0Z3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms