Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem88Q9D0N8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms