Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdca7Q9D0M2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdca7Q9D0M2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdca7Q9D0M2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdca7Q9D0M2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdca7Q9D0M2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdca7Q9D0M2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdca7Q9D0M2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdca7Q9D0M2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdca7Q9D0M2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdca7Q9D0M2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdca7Q9D0M2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdca7Q9D0M2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdca7Q9D0M2 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdca7Q9D0M2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdca7Q9D0M2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdca7Q9D0M2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdca7Q9D0M2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdca7Q9D0M2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdca7Q9D0M2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdca7Q9D0M2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdca7Q9D0M2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdca7Q9D0M2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdca7Q9D0M2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdca7Q9D0M2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdca7Q9D0M2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdca7Q9D0M2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms