Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0A3

Arpin, Arpin, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArpinQ9D0A3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ArpinQ9D0A3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ArpinQ9D0A3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArpinQ9D0A3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArpinQ9D0A3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArpinQ9D0A3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArpinQ9D0A3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArpinQ9D0A3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArpinQ9D0A3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArpinQ9D0A3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ArpinQ9D0A3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms