Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmss1Q9CZT6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms