Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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