Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmem39aQ9CYC3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms