Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bud23Q9CY21 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bud23Q9CY21 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bud23Q9CY21 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bud23Q9CY21 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bud23Q9CY21 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bud23Q9CY21 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bud23Q9CY21 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bud23Q9CY21 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bud23Q9CY21 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bud23Q9CY21 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Bud23Q9CY21 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bud23Q9CY21 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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