Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgo1Q9CXH7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo1Q9CXH7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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