Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed5Q9CXE7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms