Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd12Q9CWU0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms