Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb2bQ9CWF2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb2bQ9CWF2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms