Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Snw1Q9CSN1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms