Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CRW3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CRW3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CRW3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CRW3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CRW3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149 ms