Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CRC3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CRC3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9CRC3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CRC3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CRC3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CRC3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9CRC3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRC3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms