Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Exosc5Q9CRA8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms