Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl28Q9CR40 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms