Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR08

Pop4, Ribonuclease P protein subunit p29, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop4Q9CR08 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop4Q9CR08 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pop4Q9CR08 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pop4Q9CR08 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms